Chefias da Capitania
Capitão-de-Mar-e-Guerra
Capitão dos Portos
Comandante máximo da Capitania dos Portos, responsável por todas as operações marítimas e administrativas.
Capitão-de-Fragata
Segundo Comandante
Responsável pelas operações de segurança marítima e fiscalização naval.
Tenente
Chefe de Operações
Responsável pelo centro de operações e coordenação de missões.
Primeiro-Sargento
Supervisor de Segurança
Responsável pela segurança das instalações e pessoal.
Segundo-Sargento
Engenheiro Naval
Responsável pela manutenção das embarcações e equipamentos.
Cabo
Supervisor de Porto
Responsável pelas operações portuárias e logística.